韩方普博士研究组的主要研究方向是小麦和玉米功能基因组、小麦染色体工程育种及植物人工染色体研究。研究课题主要包括远缘杂交育种和多倍体基因组进化、植物减数分裂、植物着丝粒的结构和功能、植物人工染色体以及植物基因定点突变及定向重组。
1.远缘杂交育种和多倍体基因组进化
    重点研究多倍体作物小麦及小偃麦的形成过程及机制。高效地转移、鉴定和跟踪外缘基因，发掘具有重要育种价值的易位系和关键基因。揭示多倍体作物中基因组之间的互作与优势的分子机理；创制、鉴定和评价小片段易位系和近缘种全基因组渗入系；分离并详细研究来自野生物种的高产、优质、抗病虫和抗逆基因；培育高产稳产、优质高效、抗病和耐逆的作物新品种。本项目由科技部863重大项目资助。
2.植物减数分裂
    减数分裂过程中同源染色体的配对起始、重组、取向和分离的分子机理是国际上研究的热点。将以小麦和玉米的特殊突变体为材料来研究上述问题，分离减数分裂相关基因并阐明其功能。本项目由科技部重大研究计划项目资助。
3.植物着丝粒的结构和功能
    在玉米着丝粒功能研究领域：研究玉米染色体着丝粒功能“失活-激活”的表观遗传学调控机制。探讨DNA甲基化、组蛋白修饰以及小RNA与着丝粒功能的内在联系。本项目由国家自然科学基金重点项目资助。
4.植物人工染色体构建以及植物基因定点突变与重组
    将利用不同的方法构建植物人工染色体。构建和优化适合多基因或完整代谢途径遗传转化的转基因载体。随着玉米基因组测序完成，需要发展一种有效方法来利用已知序列信息进行定点突变和置换，避免位置效应而进行重要基因功能的鉴定。本项目由科技部转基因植物专项经费资助。