植物细胞与染色体工程国家重点实验室作为我国农业生物领域的一个应用基础研究实验室，面向国家需求，20年来一直致力于为我国农业科技发展做出应有贡献。实验室在李振声院士提出的“少投入、多产出，保护环境，可持续发展”的总体研究思路的指导下，开展各种基础理论和应用研究，在各个方面取得了可喜的成绩，先后获得国家级奖励6 项，省部级奖励7 项，中国科学院及其他奖励3项，其中包括 2006 年李振声院士获得了“国家最高科学技术奖”，此外还获得国家发明一等奖、陈嘉庚农业科技奖、何梁何利科技进步奖、中华农业英才奖等；由于实验室在植物体细胞遗传学和花粉单倍体遗传育种研究方面的突出成绩，曾获得国家自然科学二等奖和中国科学院自然科学一等奖等奖项。